Creates a graph of class graphMCP from a given transition
matrix or vice versa.
Arguments
- m
A transition matrix.
- weights
A numeric for the initial weights.
- graph
A graph of class
graphMCP.
Value
A graph of class graphMCP with the given transition
matrix for matrix2graph. The transition matrix of a graphMCP
graph for graph2matrix.
Details
The hypotheses names are the row names or if these are NULL, the
column names or if these are also NULL of type H1, H2, H3, ...
If the diagonal of the matrix is unequal zero, the values are ignored and a warning is given.
Author
Kornelius Rohmeyer rohmeyer@small-projects.de
Examples
# Bonferroni-Holm:
m <- matrix(rep(1/3, 16), nrow=4)
diag(m) <- c(0, 0, 0, 0)
graph <- matrix2graph(m)
print(graph)
#> A graphMCP graph
#> H1 (weight=0.25)
#> H2 (weight=0.25)
#> H3 (weight=0.25)
#> H4 (weight=0.25)
#> Edges:
#> H1 -( 0.333333333333333 )-> H2
#> H1 -( 0.333333333333333 )-> H3
#> H1 -( 0.333333333333333 )-> H4
#> H2 -( 0.333333333333333 )-> H1
#> H2 -( 0.333333333333333 )-> H3
#> H2 -( 0.333333333333333 )-> H4
#> H3 -( 0.333333333333333 )-> H1
#> H3 -( 0.333333333333333 )-> H2
#> H3 -( 0.333333333333333 )-> H4
#> H4 -( 0.333333333333333 )-> H1
#> H4 -( 0.333333333333333 )-> H2
#> H4 -( 0.333333333333333 )-> H3
#>
graph2matrix(graph)
#> H1 H2 H3 H4
#> H1 0.0000000 0.3333333 0.3333333 0.3333333
#> H2 0.3333333 0.0000000 0.3333333 0.3333333
#> H3 0.3333333 0.3333333 0.0000000 0.3333333
#> H4 0.3333333 0.3333333 0.3333333 0.0000000